由于職能和業務的不同，用戶的應用系統及其數據交換方式也多種多樣：各種審批系統、各種數據查詢系統需要在網絡間傳輸和交換定數據庫記錄；各種匯總系統、各種數據采集系統需要在網絡間傳輸和交換定文件；各種復雜的應用系統需要傳輸和交換定制數據；內外網之間的郵件互通和網頁瀏覽需求要求網絡之間能夠進行郵件轉發和網頁轉發。故主流的安全隔離網閘一般具有如下功能模塊：數據庫模塊、文件模塊、消息模塊、郵件模塊和瀏覽模塊。

　　安全隔離網閘的三個基本部分功能：

　　1.內網處理單元：包括內網接口單元與內網數據緩沖區。接口部分負責與內網的連接，并終止內網用戶的網絡連接，對數據進行病毒檢測、防火墻、入侵防護等安全檢測后剝離出“純數據”，作好交換的準備，也完成來自內網對用戶身份的確認，確保數據的安全通道；數據緩沖區是存放并調度剝離后的數據，負責與隔離交換單元的數據交換。

　　2.外網處理單元：與內網處理單元功能相同，但處理的是外網連接。

　　3.隔離與交換控制單元：是網閘隔離控制的擺渡控制，控制交換通道的開啟與關閉。控制單元中包含一個數據交換區，就是數據交換中的擺渡船。對交換通道的控制的方式目前有兩種技術，擺渡開關與通道控制。擺渡開關是電子倒換開關，讓數據交換區與內外網在任意時刻的不同時連接，形成空間間隔GAP，實現物理隔離。通道方式是在內外網之間改變通訊模式，中斷了內外網的直接連接，采用的通訊手段形成內外網的物理隔離。該單元中有一個數據交換區，作為交換數據的中轉。

　　安全隔離網閘內部通道一般也采用非通用網絡的通訊連接，讓來自兩端的可能攻擊終止于接口單元，從而增強網閘的隔離效果。設計的目的，是隔離內外網業務連接的前提下，實現安全的數據交換。也就是安全專家描述的：協議落地，數據交換。